Beboere i Sydsudan har mulighed for at forfølge de videregående uddannelser i enten et universitet eller en erhvervsskole. Selv om der er mangel på begge institutioner, flere programmer er på plads til at udvide den nuværende landskab af videregående uddannelser i Sydsudan.

MSc, eller Master of Science, er en internationalt anerkendt akademisk grad, der angiver færdigheder og viden om et givet emne eller område. De fleste MSc programmer tager omkring fire år til at afslutte, hvorefter nogle deltage i arbejdsstyrken, mens andre fortsætter i klasseværelset.