MSc i Bioinformatik til Computational Genomics

Kandidatuddannelsen ("Laurea Magistrale") i "Bioinformatik til Computational Genomics " er et fælles initiativ fra University of Milan og Politecnico di Milano , og vil blive aktiveret fra og med akademiåret 2019-2020.

Samlet set sigter det på at danne "genomforskere" , det vil sige kandidater, der vil have en tilstrækkelig viden om molekylære grundlaget for biologiske systemer; struktur og funktion af biologiske molekyler og hvordan de deltager i cellulære processer; teknologier og platforme til analyse af genomer; redskaberne til bioinformatik og genomisk analyse; og de statistiske og beregningsmæssige metoder til analyse af biomolekylære data.

Adgang er åben for alle elever med en bachelorgrad ("Laurea Triennale") enten i biologi eller bioteknologi eller lignende ELLER datalogi, teknik, matematik eller fysik.

Ved at deltage i kurserne undervist i BCG-graden, vil du lære om:

1. Organiseringen af information i genomet og de molekylære og cellulære processer på basis af genekspression og dets regulering.
2. De eksperimentelle metoder anvendt til at studere gener og deres funktion i forskellige modelarter, både prokaryote og eukaryote.
3. De teknologier, der anvendes i moderne genomisk og epigenomisk forskning, som næste generations sekventeringsbaserede assays (genom- og exomsekventering, RNA-sekventering, ChIP-Seq osv.).
4. Metoder og protokoller til bioinformatisk analyse i funktionelle genomforskninger (genom- og exomsekventering, RNA-sekventering, ChIP-Seq osv.).
5. De algoritmiske, matematiske og statistiske tilgange, der ligger til grund for bioinformatik og genomiske analyseværktøjer.
6. Databaseteknologier til lagring og organisering af dataene.
7. Modellering og analyseteknikker anvendt i systembiologi til undersøgelse af interaktioner i komplekse biologiske systemer.

Programmet omfatter som et grundlæggende skridt i dannelsen af eleverne en praktikplads i forskningslaboratorier enten ved University of Milan, Politecnico eller i andre italienske eller udenlandske forskningsinstitutter. Praktikopholdets forskningserfaring og dens resultater vil blive beskrevet i en endelig skriftlig afhandling, der skal drøftes foran et specialeudvalg.

Mission og mål

Den fælles kandidatgrad i "Bioinformatics for Computational Genomics" (BCG) fra Politecnico di Milano og Università Degli Studi di Milano sigter mod at give sine kandidater en tilstrækkelig viden om det molekylære grundlag af biologiske systemer; strukturen og funktionen af biologiske molekyler, og hvordan de deltager i cellulære processer; teknologier og platforme til analyse af genomer værktøjerne til bioinformatik og genomisk analyse og de statistiske og beregningsmæssige metoder til analyse af biomolekylære data.

Derfor omfatter BCG-graden aktiviteter, der giver indgående kendskab til:

• Organiseringen af information i genomet og de molekylære og cellulære processer på basis af genekspression og dets regulering.
• De eksperimentelle metoder anvendt til at studere gener og deres funktion i forskellige modelarter, både prokaryote og eukaryote.
• De teknologier, der anvendes i moderne genomforskning.
• Metoder og protokoller til bioinformatisk analyse i funktionelle genomforskninger.
• Algoritmiske, matematiske og statistiske tilgange, der ligger til grund for bioinformatik og genomiske analyseværktøjer.
• Databaseteknologier til lagring og organisering af dataene.
• Modellering og analyseteknikker anvendt i systembiologi til undersøgelse af interaktioner i komplekse biologiske systemer.

emner

Università Degli Studi di Milano vil tilbyde kurserne med fokus på biologiske emner, mens Politecnico di Milano vil tilbyde de beregningsmæssige.

1. år

1. semester

• Obligatoriske kurser: Organisk kemi; Bioinformatik og Computational Biology
• Valgfrie kurser: genetik, cellulær og molekylærbiologi; Biokemi; Programmering og databaser; Statistikker

2. semester

• Obligatoriske kurser: Genomics og transcriptomics; Videnskabelig programmering; Maskinelæring; Biostatistik

2. år

1. semester

• Obligatoriske kurser: Advanced Genomics and Epigenomics; Strukturel kemi; Systembiologi og netværksanalyse
• Valgfrie kurser: Tværfagligt projekt; Genomisk Big Data Management og Computing

Karrieremuligheder

BCG-kandidatuddannelsen sigter mod at uddanne "dataforskere", højt kvalificerede fagfolk, der er i stand til at fusionere dybdegående viden om de molekylære fundamenter inden for biovidenskab med opdateret viden om de nuværende teknikker og teknologier til bioinformatik og genomisk analyse. Der lægges særlig vægt på de kvantitative og beregningsmæssige aspekter af de senere, som vil være fokuseret på analyse, modellering og forståelse af biologiske systemer. Det ultimative mål er at træne i en tværfaglig sammenhæng fagfolk, der er klar til at klare de udfordringer, der stammer fra moderne biomolekylære videnskaber i den post-genomiske æra, og i stand til at konjugere og integrere viden om biologi, genetik, datalogi, informationsteknologi og statistik inden for forskellige områder af grundlæggende eller anvendt forskning.

Kandidater i BCG vil således kunne:

• Deltag i design og udførelse af store genomiske analyser.
• Identificer og uddrag den biologiske betydning fra de opnåede resultater.
• Design værktøjer og protokoller til bioinformatisk analyse af forskellige typer eksperimentelle data autonomt.
• Spil en central rolle i forskningsgrupper med fokus på grundlæggende eller anvendt genomforskning.
• Koordinere og overvåge forskningsprojekter og grupper med fokus på bioinformatik og genomik.

Adgang

Forudsætningen for at få adgang til BCG-kandidatuddannelsen er en bachelorgrad ("Laurea Triennale"), der giver tilstrækkelig viden om enten (1) genetik, molekylærbiologi og biokemi eller (2) datalogi, informationsteknologi og matematik. Kendskab til det engelske sprog kræves også som angivet nedenfor. Studerende, der stadig ikke har afsluttet deres bachelorgrad, kan ansøge, hvis de planlægger at opgradere inden 31. oktober 2019 (se nedenfor).

For akademiske år 2019-2020 vil der blive optaget maksimalt 50 studerende på programmet , udvalgt ud fra deres baggrundskendskab og et personligt interview.

Adgangskrav

Adgangskrav til italienske studerende

Italienske studerende kan ansøge om BCG-kandidatuddannelsen, forudsat at de opfylder et af følgende to krav:

• De har gennemført en bacheloruddannelse (Laurea Triennale) i en af følgende klasser:
• Bioteknologi (klasse L2)
• Biologi (klasse L13)
• Landbrug og fødevarevidenskab (klasse L26)
• Farmakologiske videnskaber (klasse L29)
  • Bioteknologi (klasse L2)
  • Biologi (klasse L13)
  • Landbrug og fødevarevidenskab (klasse L26)
  • Farmakologiske videnskaber (klasse L29)

og i løbet af deres studier har de erhvervet mindst 30 CFU i biologiske områder (SSD BIO) med mindst 18 CFU i genetik (BIO / 18), Molecular Biology (BIO / 11) og Biokemi (BIO / 10)

ELLER

• De har gennemført en bacheloruddannelse (Laurea Triennale) i en af følgende klasser:
• Informationsteknologi (klasse L8)
• Computervidenskab (klasse L31)
• Fysik (klasse L30)
• Matematik (klasse L35)
  • Informationsteknologi (klasse L8)
  • Computervidenskab (klasse L31)
  • Fysik (klasse L30)
  • Matematik (klasse L35)

og i løbet af deres studier har de erhvervet mindst 30 CFU inden for datalogi, informationsteknologi, biomedicinsk teknik, matematik og / eller statistik (SSD INF / 01, ING-INF / 05, ING-INF / 06, MAT / 01 -09 og / eller SECS-S / 01), med mindst 6 CFU i matematik (MAT / 01-09) og mindst 12 CFU på et eller flere af følgende områder: computervidenskab (INF / 01) ingeniørfag (ING-INF / 05), biomedicinsk teknik (ING-INF / 06), statistik (SECS-S / 01).

De samme kriterier gælder for kandidater i besiddelse af udenlandske universitetsgrader, der anses for at være egnede af lærerrådet, hvor det er muligt klart at identificere discipliner og antal kreditter erhvervet for hver disciplin. Hvis dette ikke er muligt, vil de dokumenter, der bekræfter kandidaternes karriere, blive undersøgt detaljeret af lærerrådet for at vurdere, om deres baggrund opfylder de tidligere krav.

Undergraduate studerende kan ansøge, men bliver nødt til at opnå deres bachelorgrad (Laurea Triennale) inden 31. oktober 2019.

Adgangskrav til udenlandske studerende

• Studerende i besiddelse af en bachelorgrad i et område, der er beskrevet i det foregående punkt (Krav til italienske studerende), hvor kurser, der gennemføres i de krævede discipliner, kan identificeres tydeligt sammen med antallet af timer / point på kurserne. Hvis dette ikke er muligt, vil de dokumenter, der bekræfter studerendes karriere, blive undersøgt af lærerrådet for at vurdere, om deres baggrund opfylder de tidligere krav.

Sprogkrav

• Studerende skal være dygtige i engelsk med et B2-niveau af kompetence. Studerende, der allerede er tilmeldt universitetet i Milano, og som ikke har et B2-certifikat eller tilsvarende, opfordres til at tage en placeringsprøve for at bevise deres kompetence og bevise det under interviewet. I undtagelsestilfælde kan studerende uden B2-placeringstest accepteres på den betingelse, at deres niveau af engelskfærdighed, vurderet under interviewet, åbenbart er godt.
• Kendskab til italiensk er ikke nødvendig for deltagelse. Som krævet i forskrifter skal udenlandske studerende imidlertid påvise, at de har erhvervet grundlæggende kendskab til det italienske sprog inden afslutningen af afhandlingen.

Udvælgelse og rangering

Studerende, der opfylder ovennævnte forudsætninger, vil blive optaget til et interview med medlemmer af undervisningsrådet for vurdering af deres videnskabelige baggrundskendskab.

Kandidaternes tilstrækkelige personlige forberedelse (i deres baggrundstemaer), deres evne til at kommunikere på engelsk og deres motivation er afgørende for optagelsen. Interviewet evaluerer kandidatens ekspertise inden for emner relateret til deres bachelorgrad.

Udvalget vil evaluere hver ansøger på 100-skalaen:

• Op til 50/100 point vil blive tildelt til ansøgerens genoptagelse (type bachelorgrad deltog, eksamenskurser, yderligere kurser deltog, yderligere grader mv)
• Op til 50/100 point vil blive tildelt til interviewet.

Mindste score for adgang er 60/100.

For det akademiske år 2019-2020 finder interviews med italienske studerende og udenlandske studerende, der er bosiddende i Italien, sted ved Institut for Biovidenskab, Via Celoria 26, den 16. juli 2019 kl. 9.30.

Udenlandske ansøgere, der ikke er bosiddende i Italien og har opnået deres bachelorgrad i udlandet, kan vælge et online-interview. I begyndelsen af interviewet skal de studerende vise et gyldigt ID-kort eller pas til identifikation.

Tilmelding efter optagelse

Når resultaterne er offentliggjort, skal studerende, der besætter de første 50 stillinger i fortjenesteplaceringen, gennemføre deres tilmelding inden for den frist, der er angivet i konkurrencemeddelelsen. Efterfølgende, hvis de første 50 ledige stillinger ikke er mættede efter den indledende frist, vil indskrivning være mulig for studerende med lavere rang, forudsat at de har opnået mindst 60/100 i optagelsesprøven. Tilmelding til studerende vil kun blive valideret, hvis de opnår deres bachelorgrad (Laurea Triennale for italienske studerende) inden 31. oktober 2019. Studerende fra andre universiteter skal efter eksamen inden 31. oktober 2019 fremlægge certificering af den tildelte grad ved Segreteria Studenti.